(1)不同的犯罪手段
包庇罪以虚假证明、帮助毁灭犯罪痕迹、隐匿或者毁灭犯罪证据等手段，不要求利用职务之便进行包庇；徇私枉法罪的掩盖手段一定是利用职务之便，通过办案活动实现包庇罪犯罪的目的。
(2)不同的犯罪主体
徇私枉法罪的主体只能是司法工作人员，属于特殊主体；而包庇罪是一般主体，即任何达到刑事责任年龄，具有刑事责任能力的人都可以构成。
(3)作案时间不同。
犯包庇罪的人实施包庇行为，可以在犯罪人实施犯罪后的任何阶段进行，可以在侦查、预审、起诉、审判阶段进行，也可以在判决后进行；但犯徇私枉法罪的人的包庇行为，通常发生在判决之前。如果司法工作人员在判决生效后实施诈骗，让犯罪分子逍遥法外，则构成私自释放在押人员罪，不能用徇私枉法罪处罚。
